内蒙古阿鲁科尔沁国家级自然保护区位于内蒙古自治区赤峰市阿鲁科尔沁旗境内，地处科尔沁沙地北缘，处于我国北方半干旱农牧交错区。最典型的地貌是草原，但又不像内蒙古大草原那样碧绿平坦，而是具有代表性的沙地草原。保护区总面积13.7万公顷，流动及半流动沙地面积为4.4万公顷，约占保护区总面积的32%，生态环境较为脆弱。主要保护对象为沙地草原、湿地生态系统及珍稀鸟类。

内蒙古阿鲁科尔沁国家级自然保护区是东亚迁徙鸟类南北迁徙的重要通道和驿站，迁徙季节有成千上万的候鸟飞临保护区停歇觅食。

1998年成立保护区。
2005年晋升为国家级自然保护区。

内蒙古阿鲁科尔沁国家级自然保护区（ 43° 48′30″--44°28′31″ N、119°55′02″--120°41′27″ E）位于内蒙古自治区阿鲁科尔沁旗东部、科尔沁沙地北部，是东北平原向内蒙古高原的过渡地带，保护区地跨赛扎嘎斯台镇、坤都镇、罕塔拉苏木、罕苏木4个苏木镇，南与该旗道德镇接壤，东与通辽市扎鲁特旗毗邻。

该自然保护区海拔309 ～ 548 m，年均降水量318 mm，年均温6 ℃左右，无霜期130 ～ 140 d。

保护区河流系统主要有乌力吉沐沦河和黑哈尔河两大河流，并在保护区东南部汇合，汇入西拉沐沦河，两大河流年均径流量分别为1852万立方米，9436万立方米，其境内河流总面积5471.2公顷，占保护区面积的4.0%，占湿地面积的20.7%。

保护区共有7个植被型，54个群系，主要植被类型有水生植被、沼泽植被、草甸植被、草原植被、丘陵坡地半灌木丛植被、丘陵坡地灌丛植被和沙地复合植被。

从景观水平看保护区共有四大景观区域过程，北部为波状起伏的丘陵山地灌丛草原景观，北部及东南部为众多湖泊群即由河流发育成的湿地景观，保护区境内连绵起伏的沙地草原景观，保护区沙地景观中分布有退化的典型草原景观，在不同的区域中分布草原，湿地，林地的生态系统，草原生态系统分布有疏林灌丛草原，典型草原，羊草草原等。

保护区总面积达137298公顷。其中核心区面积为48989.75公顷，占自然保护区总面积的35.81%。核心区分南北两个，南部扎嘎斯台核心区面积27177.0公顷，北部坤都核心区面积21812.75公顷。缓冲区面积42320.85公顷，占总面积的30.94%。实验区面积45483.03公顷，占总面积的33.25%。

保护区境内湿地总面积为26412.8公顷，占保护区总面积的19.20%，湿地生态系统主要包括湖泊系统、河流系统和沼生系统三种类型。保护区境内分布的湖泊总面积为4463.7公顷，占保护区面积的3.25%，占湿地总面积的17.2%，它由分布于保护区境内的哈日朝鲁诺尔、阿日包力格诺尔、益和他拉诺尔、浑尼吐诺尔、达拉哈诺尔、图布力泡子等几十个常年积水泡子及数百个小泡子组成湖泊群。

阿鲁科尔沁国家级自然保护区内共有野生维管束植物70科222属373种。

保护区内有野生脊椎动物27目63科136属220种，其中，鱼类13种、两栖爬行类4种、鸟类172种和哺乳类31种；

保护区内分布有34种珍稀鸟类，鸿雁、丹顶鹤、白枕鹤，大鸨、黑嘴鸭、遗鸥、青头潜鸭等为世界濒危鸟类，国家一级保护鸟类有丹顶鹤、大鸨、遗鸥、黒鹳四种，国家二级保护鸟类大天鹅、小天鹅，白琵鹭、燕隼，红隼，等28种。

根据中国政府与日本政府签订的中日保护鸟及其栖息环境协定有81种列为保护鸟类。保护区内有100种鸟类列入国家保护的有益的或有重要经济科学研究价值的野生动物名单，占自然保护区鸟类总数的66%。并且珍稀濒危鸟类的种类多数量大具有极高的保护价值。

由于阿鲁科尔沁保护区境内水源丰富，湿地众多，分布有多样的生态系统和丰富的物种资源，使之成为科尔沁沙地北部的天然生态屏障，是科尔沁沙地重要的水源涵养、防洪调蓄和水源供给区域，是鸟类南北迁徙的重要通道和驿站，同时也是众多珍稀鸟类的重要繁殖区，更是环境演化的敏感区域，自然保护区对科尔沁沙地的气候调节、生态平衡和植被恢复都具有十分重要的意义，保护对象具有重要的国家级保护价值。